Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYLDQ9NQC7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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