Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB9BQ9NP90 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB9BQ9NP90 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB9BQ9NP90 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB9BQ9NP90 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB9BQ9NP90 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB9BQ9NP90 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RAB9BQ9NP90 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9BQ9NP90 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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