Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB18Q9NP72 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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RAB18Q9NP72 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RAB18Q9NP72 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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