Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CADM1Q9BY67 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms