Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VAMP8Q9BV40 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms