Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SEC22CQ9BRL7 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SEC22CQ9BRL7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms