Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms