Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SAMD8Q96LT4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms