Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIRT1Q96EB6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms