Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUPD1Q68J44 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms