Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C9orf135Q5VTT2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms