Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEP350Q5VT06 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms