Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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C10orf55Q5SWW7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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C10orf55Q5SWW7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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C10orf55Q5SWW7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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C10orf55Q5SWW7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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C10orf55Q5SWW7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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C10orf55Q5SWW7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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C10orf55Q5SWW7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
C10orf55Q5SWW7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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