Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RFTN2Q52LD8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms