Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms