Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLFNL1Q499Z3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms