Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms