Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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GABRA6Q16445 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GABRA6Q16445 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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