Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF2Q15853 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms