Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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