Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCARF1Q14162 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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