Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A3Q14050 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A3Q14050 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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