Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NCOA4Q13772 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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