Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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