Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SRSF6Q13247 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SRSF6Q13247 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SRSF6Q13247 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SRSF6Q13247 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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