Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FOXD4Q12950 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD4Q12950 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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