Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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STX4Q12846 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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STX4Q12846 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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