Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP1-1Q07627 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms