Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TFAMQ00059 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms