Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms