Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms