Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ME1P48163 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ME1P48163 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ME1P48163 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME1P48163 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME1P48163 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME1P48163 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME1P48163 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME1P48163 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ME1P48163 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ME1P48163 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms