Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
CDKN1BP46527 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms