Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF5P43026 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDF5P43026 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms