Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAP2P40123 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAP2P40123 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms