Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CASQ1P31415 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASQ1P31415 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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