Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP5DP30049 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms