Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSPAN8P19075 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms