Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TPRP12270 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TPRP12270 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms