Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C8orf89P0DMQ9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms