Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DENRO43583 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DENRO43583 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
DENRO43583 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
DENRO43583 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms