Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLGNO14967 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLGNO14967 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms