Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E2F3O00716 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms