Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DGG1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DGG1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DGG1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DGG1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms