Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOBPA7XYQ1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms