Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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