Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POMPQ9Y244 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POMPQ9Y244 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POMPQ9Y244 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POMPQ9Y244 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POMPQ9Y244 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms