Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATXN7L1Q9ULK2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms