Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRBP1Q9P2E9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms