Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTNNBIP1Q9NSA3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms